Konec druhé světové války v květnu roku 1945 znamenal pro Kračín stejně jako pro mnoho dalších obcí v českém pohraničí začátek zcela nové kapitoly. Události následujících let zásadně změnily nejen národnostní složení obyvatelstva, ale také podobu celé obce a její další vývoj.
Nejvýznamnější změnou se stal odsun německého obyvatelstva, který probíhal na základě poválečných opatření známých jako Benešovy dekrety. V rámci tohoto procesu bylo z Československa vysídleno více než 2,5 milionu obyvatel německé národnosti. Kračín, jehož obyvatelstvo bylo před válkou téměř výhradně německé, byl touto událostí zasažen mimořádně výrazně. Vesnici musela opustit převážná většina jejích obyvatel, čímž došlo k náhlému přerušení kontinuity života, která se zde utvářela po mnoho staletí.
Následkem odsunu nastal výrazný demografický úpadek. Z kdysi živé obce zůstala jen malá část původního osídlení. Zatímco ještě v roce 1930 žilo v Kračíně více než sto obyvatel, při sčítání lidu v roce 1950 zde bylo zaznamenáno již pouze 66 obyvatel. Ani v dalších desetiletích se počet trvale žijících obyvatel nepodařilo obnovit na předválečnou úroveň.
Poválečné osidlování přivedlo do Kračína nové obyvatele, především české rodiny z vnitrozemí a repatrianty vracející se z různých částí Evropy. Přestože se snažili navázat na hospodářský i společenský život obce, nepodařilo se již obnovit její někdejší velikost ani význam. Řada usedlostí zůstala opuštěná a některé postupně zanikly.
Významné změny nastaly také ve správním uspořádání. Kračín přestal být samostatnou obcí a byl postupně začleněn pod správu Tisu u Blatna. V pozdějších letech spadal pod obec Žihle a teprve po společenských změnách na konci 20. století se v roce 1990 opět stal místní částí obce Tis u Blatna, kterou je dodnes.
Poválečné události tak znamenaly pro Kračín jeden z největších historických zlomů. Během několika málo let se změnilo obyvatelstvo, správní uspořádání i charakter celé vesnice. Přesto si Kračín zachoval své místo na mapě a dodnes připomíná složitou historii českého pohraničí ve 20. století.